目前欧盟碳交易体系的交易场所主要是洲际交易所（ICE）和欧洲能源交易所（EEX），两个交易所的功能基本一致。在早期欧洲碳交易场所主要有欧洲能源交易所、欧洲气候交易所（ECX）、欧洲环境交易所（BlueNext）、北欧电力交易所（Nordpool），经历多年发展后，欧洲气候交易所、欧洲环境交易所由于各种原因已经不再进行EUA等碳配额的交易，最后形成了洲际交易所和欧洲能源交易所并行的格局。

ICE在2010年将ECX的业务并入自身，形成了欧洲最大的能源期货交易所。其服务范围包括衍生品交易、场外交易、清算服务、数据服务，目前在碳交易方面的产品主要包括一级市场的碳排放配额拍卖，二级市场的EUA、EUAA期货等相关金融衍生品。此外，ICE还提供北美洲地区的碳交易服务，如加州碳配额、美国区域减排计划碳配额以及碳配额相关的金融衍生品。

EEX成立于2002年，由莱比锡能源交易所和法兰克福欧洲能源交易所合并而成，目前是欧洲核心能源交易所之一。其服务范围与ICE类似，但是较ICE多了现货交易，因此EEX的交易产品包括一级市场的碳排放配额拍卖，二级市场的EUA和EUAA现货、EUA和EUAA期货等金融衍生品，其中现货交易为主。此外，EEX还与北京绿色交易所、广州碳排放权交易所、上海环境能源交易所达成了战略合作伙伴关系，标志着欧盟与我国共同探索碳排放权交易市场的建设。

在交易流程方面，两个交易所均为开立账户、产品交易、交易清算。在开立账户中，两个交易所均实行会员制，要求参与碳交易的主体开立账户，并每年提交会员费。目前一些大型企业，如BP、壳牌等企业很早就取得了交易所的会员资格。同时，一些体量相对较小、企业内部碳管理制度不完善的企业为了降低成本，通过银行和经纪人以“订单传递”的方式参与到碳交易中，自己不作为会员来参与交易，避免了提交会员费。在交易清算中，ICE和ECC（EEX的清算机构）将作为中央清算机构进行服务，一方面将卖方的配额划转至自身账户，另一方面将等量配额划转至买方账户，将降低了交易主体面临的风险。

虽然两个交易所的产品结构和交易流程较为一致，但是还是存在一定区别。在一级市场上，ICE主要对英国碳配额进行拍卖，EEX对欧盟碳排放配额、德国碳排放配额、波兰碳排放配额进行拍卖。在二级市场上，ICE主要开展EUA期货等金融衍生品的交易，EEX则是EUA现货、期货均有交易，但是以现货为主。