财政专项奖励资金申请受理部门为节能服务公司实施的合同能源管理项目所在地的省级财政部门、节能主管部门。《备案通知》中明确，备案名单内的节能服务公司在全国各地实施的合同能源管理项目，均可向项目所在地省级财政部门和节能主管部门申请财政奖励资金支持，各地不得对节能服务公司设置注册地域要求。全国各省、市、自治区根据上述政策出台地方具体申报要求，明确具体受理部门。因此节能服务公司应根据项目所在地政府具体实施细则的要求进行申请。