电力市场与碳市场的协同发展是一项复杂的系统工程，核心难点之一在于关键制度要素设计如何与我国东西部不同区域发展程度、资源禀赋的差异性特征相协调，从而实现效率与公平的有机统一。比如，我国东西部省区资源禀赋条件、发用电情况、经济发展水平及电价承受能力等差异较大，电力市场化建设必须兼顾市场效率与经济公平，妥善处理好东西部利益调整、分配问题。再比如，我国各试点省份碳市场建设时间不同，控排力度也不同，高排放企业可能不积极开展节能减排，而将生产转移到控排力度小的西部省份，引发“碳泄漏”效应，这需要厘清我国多层级碳市场体系中各个碳市场的地位、关系和作用，逐步向全国统一市场过渡。