在使用排放因子计算法时，除了活动水平数据，还需要确认相应的排放因子，即量化单位活动水平所产生的温室气体排放量的系数。这些排放因子是计算温室气体排放的另一个重要数据来源，如果选择不当，就会严重影响企业温室气体排放统计值的准确性，企业在报送温室气体排放时也必须提供这些排放因子以及其来源。如各种化石燃料的单位热值、含碳量和化石燃料的碳氧化率（用于计算E燃烧）等。根据指南，计算生产过程排放、净购入电/热产生的排放和固碳产品所隐含的排放都是采用耗量直接乘以排放因子的方式。电力排放因子应根据对应年份选取国家应对气候变化主管部门定期公布的各区域电网平均供电CO2排放因子；热力排放因子采取官方数据；燃煤的低位热值，具备条件的企业可采用实测值，但需委托有资质的专业机构根据相关标准进行检测，否则，采用指南推荐值。各类熔剂、电极、原料和固碳产品的排放因子可采取指南提供的缺省值或者直接测量。对于上述活动水平数据和排放因子，具备条件的企业最好使用实际测量的数值，这样最终的结果才能反映其真实排放水平。如果没有直接的监测值，也可用其他已有监测数据转化得到，如库存变化和销售量和值得到产出量等。