企业碳排放数据的真实性、完整性和准确性是碳市场公信力的基石。能源数据是碳核算最重要的数据来源，由于不同能源供给主体相对独立，政府、公共事业单位、企业对能源数据的掌握都不够完整、准确，全口径能源数据的归集、整理难度非常大，历史碳排放数据库缺失，很难支撑配额总量确定和企业配额分配及政府宏观调控。

碳市场建设遵循“先易后难”的原则，随着建材、水泥、化工等能源使用更多元、生产流程更复杂、过程排放更多样的行业纳入市场，MRV体系建设将更加困难。能源数据核查困难以及社会诚信体系不健全将持续困扰全国碳市场的建设，鄂尔多斯高新材料公司虚报碳排放数据等问题，是全国碳市场延期开市的原因之一，也由于数据方面的原因，水泥、电解铝也将延期至2023年纳入碳市场。建立成熟的碳测量技术，形成健全的碳排放监测核查体系仍任重而道远。