2016年1月22日，世界卫生组织（WHO）发布《厄尔尼诺与健康的全球报告》（Global Report on El Niño and Health），概述了目前人类面临的健康风险及在高风险国家厄尔尼诺事件产生的影响，指出2016年的厄尔尼诺将威胁全球约6000万人的健康，导致全球卫生紧急事件剧增，并呼吁各国加强准备和应对工作。
极端天气相关的健康影响
（1）干旱和洪水可能引发粮食安全
问题、增加营养不良，进而容易感染传染性疾病。
（2）干旱、洪水和强降雨（包括飓风）可能会导致死亡、显著的人口迁移、水和病媒传播疾病的爆发，并可能会损坏卫生设施，从而减少定期的健康服务和限制紧急情况下的医疗保健。
（3）厄尔尼诺相关的气温升高可能导致高原地区病媒传播疾病的流行。
（4）受损或被淹没的卫生基础设施可能导致水传播疾病。
（5）极端炎热和干燥的条件可能导致热浪、野火，增加烟雾和使空气质量恶化，进而引起或加剧呼吸道疾病。
（6）已受到人道主义状况（如国内流离失所者和集中难民营）影响的人群面临潮湿或干燥条件带来的健康风险。
