当海草床植被修复后，可通过土壤中有机碳的累积提高生态系统的碳储量。海草床土壤碳汇对生态系统碳汇的贡献非常显著。此外，在海草床植被修复初期，植被生长会形成一定的清除量。但考虑与国家温室气体清单计算边界一致，方法学暂不考虑海草床（草本植被）生物质形成的清除量，仅考虑土壤的碳汇作用。基于全球和我国报道的人工修复海草床中土壤碳储量的变化速率，我们估算得到每公顷海草每年可清除约2吨碳。

　　同时，考虑到海草床植被修复后，土壤中有机碳和氮的累积可提高甲烷和氧化亚氮气体的排放速率，方法学在计算清除量时也采用保守性的原则，将这两种温室气体产生的排放量在清除量中予以扣减。

　　历史上的海岸带开发活动导致我国海草床大量丧失，尽管本世纪以来我国推进了海草床生态修复工作并取得一定成效，但我国现存的海草床面积仍较小，海草床生态修复项目的规模也较小。方法学在编制过程中，基于可核查、经济性和实用性的考虑，土壤有机碳储量年变化量、甲烷和氧化亚氮年排放量等采用默认值进行计算。这些默认值来源于公开报道的海草床文献，其使用不仅符合实际情况，还可以减少碳汇项目开发过程中现场监测、核查等工作成本。