《规划》指出，在长江、巢湖等重点流域开展水生态环境质量监测，加强浮游动物群落结构、大型底栖动物物种数等指标监测，初步构建水生生物多样性监测网络，科学评估水生生物多样性状况和水生态健康状况，支撑水生态考核监测与评价。在入湖水系建设水质自动监测站并常态化运行，建立以水质自动监测为主、手工加密监测为辅的预警监测网络。加强入河排污口监测，加密汛期水体水质监测，联动预警溯源跨界监测。探索构建水质水文监测合一体系。创新监测手段，探索运用卫星遥感、无人机等技术开展流域水质、面源和生态质量监测。

　　推动高空间分辨率卫星影像解译省域全覆盖，提供高精度生态遥感监测产品，开展无人机生态环境监测。推动巢湖与黄山生态地面站纳入国家生态质量综合监测站建设序列，配合开展样地样带监测。

　　《规划》强调，结合驻市监测中心区位和能力优势，设立合肥等六大区域中心，统筹调度全省重点监测任务和跨流域跨区域监测工作，完善区域联动应急响应。“十四五”末，六大区域中心实现各环境要素全指标监测能力基本覆盖，逐步配齐水、气、土、固废等要素全因子应急监测设备和监测车辆。同时承担向周边区域进行量值溯源、量值传递及质控检查任务，协助省监测中心开展质量管理工作。