2005-2007年第一阶段（试运行期）：配额主要以免费发放的形式分配，由欧盟成员国以自下而上的形式制定各自限额，配额供给过剩，碳价一度跌至0元；

2008-2012年第二阶段：配额发放方式仍然采取欧盟成员国各自制定的形式，免费配额发放比例削减至90%，然而受经济危机的影响，工业能源需求减少，碳价仍处于较为低迷的阶段；

2013-2020年第三阶段：2013年后欧盟改革碳排放额度确定方法，取消国家分配计划，采取总量控制的形式统一欧盟范围内的碳排放量；

2021-2030年第四阶段：该阶段仍采取总量控制的分配方式，配额总量发放上限将从逐年减少1.74%变为2.2%，同时2019年初建立了市场稳定储备（MSR） 来平衡市场供需，应对可能出现的市场冲击，碳价于2018年起快速上行至2021年5月突破50欧元创新高，在MSR机制下欧盟碳市场逐步进入稳定运行期。

综合来看，欧盟碳市场前期配额供给过剩导致碳市场运行停滞和碳价低迷，后续通过减少碳排放配额上限，利用拍卖增加参与主体碳排放成本，使市场回暖。

受减排目标的压力，欧洲制造业纷纷选择向可以减轻传统能源依赖的制造服务业转型，欧盟制造业占GDP的比重从1991年的19.8％下滑至2020年的13.6％，而同一时期服务业增加值占比从1991年的59％爬升至2020年的65.8％，由此让欧盟过去15年GDP的增长划出了与二氧化碳排放量呈负向关联的漂亮轨迹。

碳市场让欧盟能源结构呈现不断优化的格局。为应对EUETS规则，欧盟企业被迫选择其他替代型能源维持生产，或者对现有技术进行进一步研发和创新以减少碳排放，欧盟的能源结构由此发生较大变化，风能、水能、光能、生物质能等可再生能源快速增长，欧盟的电力供应由此迅速地向多样化清洁能源转变，其中可再生能源发电比例上升到60％，超过煤炭和核能成为最大的发电来源，并且电力部门成为了欧洲最早脱碳的行业。