从国内碳交易试点和其他非试点地区的机构甄选规则，大多数都要求了核查机构必须注册当地，或者注册外省，在本地具有分支机构。虽然会有一些本地优势，但是形成了地方保护主义，导致外省一些具有经验的机构难以进入。同时一些本地机构虽然没有相关的经验，实力能力相对较弱，但是由于长期在本地且和当地发改委有着良好的关系，因而进入核查机构名录。这一现象可能导致部分机构存在技术缺陷或专业人员配置问题。