从“两省五市”的试点情况看，我国碳交易存在试点工作准备不够充分、法律约束力较弱、企业认可度较差、数据基础差、碳市场透明度较差、市场监管标准不一、市场流动性较差等诸多问题。

       一是试点工作启动仓促，准备不够充分。大部分试点为了满足试点工作部署的安排，均赶在2013年底启动了市场交易，最晚也不超过2014年上半年。实际上，除个别试点外，大部分试点的启动均较为仓促，准备工作并不完全充分，政策设计、能力建设等基础工作不够完善。碳交易制度是一项非常复杂的政策体系，国外碳市场从酝酿到最终出台都要经过数年的计划和长时间的讨论，而我国试点在2011年底开始部署、2012年开始开展工作、2013年启动市场，每年均为一个大台阶。基础工作不够扎实，其影响可能会在未来试点工作进一步深入之后逐渐显露出来。

        二是大部分碳排放权交易试点的法律约束力较弱。碳交易政策得以实施的基础是必须要有强制法律约束力的保障，即排放单位只能在配额许可的范围内（免费分配获得或市场交易购得）来排放二氧化碳（有的也包括其它温室气体），超出部分将会受到法律的惩罚。如果没有法律约束，或者说惩罚的力度较弱，碳交易的政策效果也难以得到完全的保障。目前试点中，只有深圳通过了地方人大立法，北京通过了人大决定，对排放单位的约束力相对较强。其它试点基本以政府令的规章进行规制，惩罚力度受到局限，因此法律约束力较弱。个别试点甚至只以红头文件为依据。

       三是企业认可度较差，接受政策需要一定的时间。碳交易从全球来说都是一个新生事物，对国内企业来说，试点工作的开展是第一次接触碳交易。由于试点工作推进速度过快，且利益相关方协商工作较为欠缺，一些企业在还未完全理解此政策的意义和目的，且不了解如何开展具体工作的情况下，就被纳入其中并被要求履行控制排放的义务。因此，企业不可避免地存在一定的排斥情绪，不仅体现在参与碳市场交易不够活跃，甚至还有一些企业对碳排放报告核查工作的配合不够积极。